USIE CHIMENOS, ANA ISABEL

Category: ADJUNCT LECTURER PART TIME T1
Academic profile: Doctorate
Department: BASIC MEDICAL SCIENCES
Email: anabel.usie@udl.cat

Teaching

Teaching Course Subject
Master's Degree in Biomedical Research BIOINFORMATICS
Master's Degree in Biomedical Research BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY
Degree in Biotechnology 3 BIOINFORMATICS
Degree in Biomedical Sciences 3 BIOINFORMATICS AND SYSTEMS BIOLOGY

Research

Research projects Start date End date Main researchers
MetRES (Metabolic REconstruction Server): desarrollo y aplicación en estudio de principios de diseño biológico 01/01/2011 31/12/2013 RUI CARLOS VAQUEIRO DE CASTRO ALVES
Publications Year Authors Type
Transcriptome dynamics of cork oak (Quercus suber) somatic embryogenesis reveals active gene players in transcriptome regulation and phytohormone homeostasis of embryo development 2019 Capote, T.; Usié, A.; Barbosa P.; Ramos, A.M.; Morais-Cecílio, L.; Gonçalves, S Article d'investigació
The draft genome sequence of cork oak 2018 Ramos , A.M.; Usié, A.; Barbosa, P.; Barros, P.M.; Capote, T.; Chaves, I.; Simões, F.; Abreu, I.; Carrasquinho, I.; Faro, C.; Guimarães, J.B.; Mendonça, D.; Nóbrega, F.; Rodrigues, L.; Saibo, N.; Vare Article d'investigació
Characterization of the cork formation and production transcriptome in Quercus cerris × suber hybrids 2018 Meireles, B.; Usié, A.; Barbosa, P.; Fortes, A.M.; Folgado, A.; Chaves, I.; Carrasquinho, I.; Costa, R.L.; Gonçalves, S.; Teixeira, R.T.; Ramos, A.M.; Nóbrega, F. Article d'investigació
Chip-Seq reveals that QsMYB1 directly targets genes involved in ligning and subering biosynthesis pathways in cork oak (Quercus suber) 2018 Capote, T.; Barbosa, P.; Usié, A.; Ramos, A.M.; Inácio, V.; Ordás, R.; Gonçalves, S. ; Morais-Cecílio, L. Article d'investigació
Comprehensive Analysis of the Cork Oak (Quercus suber) Transcriptome Involved in the Regulation of Bud Sprouting 2017 Usié, A.; Simões, F.; Barbosa, P.; Meireles, B.; Chaves, I.; Gonçalves, S.; Folgado, A.; Almeida, M.H.; Matos, J.; Ramos, A.M. Article d'investigació
Expression Profiling in Pinus Pinaster in Response to Infection with the Pine Wood Nematode Bursaphelenchus xylophilus 2017 D. Gaspar; C. Trinidade; A. Usié; B. Meireles; P. Barbosa; A. Fortes; C. Pesquita; R. Costa; A.M. Ramos Article d'investigació
Draft Genome Sequence of a Rare Pigmented Mycobacterium avium subsp. paratuberculosis Type C Strain 2017 Barbosa, P.; Leão, C.; Usié, A.; Amaro, A.; Botelho, A.; Pinto, C.; Inácio, J.; Stevenson, K.; Ramos, A.M. Article d'investigació
The CHEMDNER corpus of chemicals and drugs and its annotation principles 2015 Krallinger M, Rabal O, Leitner F, Vazquez M, Salgado D, Lu Z, Leaman R, Lu Y, Ji D, Lowe DM, Sayle RA, Batista-Navarro RT, Rak R, Huber T, Rocktäschel T, Matos S, Campos D, Tang B, Xu H, Munkhdalai T, Article d'investigació
CheNER: a tool for the identification of chemical entities and their classes in biomedical literature 2015 Usié A.; Cruz J.; Comas J.; Solsona F.; Alves R. Article d'investigació
Database Constraints Applied to Metabolic Pathway Reconstruction Tools 2014 Jordi Vilaplana; Francesc Solsona; Ivan Teixido; Anabel Usié; Hiren Karathia; Rui Alves; Jordi Mateo Article d'investigació
Biblio-MetReS for user-friendly mining of genes and biological processes in scientific documents 2014 Usie A, Karathia H, Teixidó I, Alves R, Solsona F. Article d'investigació
CheNER: Chemical Named Entity Recognizer 2014 Usie, A.; Alves, R.; Solsona, F.; Vazquez, M.; Valencia, A. Article d'investigació
Methods for and results from the study of design principles in molecular systems 2011 Salvado B.; Karathia H.; Chimenos AU.; Vilaprinyo E.; Omholt S.; Sorribas A.; Alves R. Article d'investigació
Biblio-MetReS: A bibliometric network reconstruction application and server 2011 Usie A.; Karathia H.; Teixido I.; Valls J.; Faus X.; Alves R.; Solsona F. Article d'investigació
Modelo de asignación de tareas en entornos multicluster heterogéneos y no dedicados 2009 Blanco, H.; Lérida, JL; Guirado, F; Usié, AI. Capítol de llibre d'investigació